Túlio, boa noite. Estou com o mesmo problema e não encontrei uma solução diretamente via programa do OBS. A forma com que tenho feito o encerramento das gravações sem perdê-la é via gerenciador de tarefas. Lá, procure por "detalhes" (no win11 fica na barra lateral esquerda.
Encontre o arquivo obs-ffmpeg-mux.exe e finalize-o. Irá encerrar a gravação sem perder nada.
Único detalhe é que na gravação você não consegue mexer na barra de progresso (ir até o final, por exemplo). O que eu faço é converter para mp4, assim posso verificar se a gravação foi correta.
Espero que funcione pra você e, ainda assim, espero muito que alguém possa dar uma luz para resolver esse problema.
Abraço!